קרן הצדקה שעל יד ישיבת ההסדר בירוחם (ע"ר) הינה עמותת חסד שהחלה ביוזמת בני המחזור הראשון בישיבה. כיום פועלת הקרן במגוון תחומי סיוע כלכלי ברחבי ירוחם והסביבה ובשיתוף פעולה הדוק עם המחלקה לשירותים חברתיים בעיירה, כאשר רוב ממתנדביה הינם בוגרי ואברכי הישיבה.
בין מפעלי קרן הצדקה ניתן לציין ליווי עשרות משפחות להתנהלות כלכלית מחושבת, הלוואות ללא ריבית ומבצעי סיוע לקראת החגים.
קרן הצדקה פועלת על טהרת המתנדבים לאורך כל השנה, רובם תלמידים מהשיעורים הגבוהים בישיבה או מבוגריה. הישיבה כולה זוכה לסייע באופן משמעותי במיוחד במבצעי הסיוע בחגים (ראש השנה, פורים ופסח) בחלוקת החבילות ובארגון הלוגיסטי.
